عنوان
بررسي ارزش تشخيصي RNA هاي حلقوي hsa-cric-0001785 (circ-ELP3) و hsa-circ-100219 (circ-FAF1) در سرم بيماران مبتلابه سرطان پستان
نويسنده اصلي
اميد شفاعت، رامتين
محل تحصيل
دانشگاه علوم پزشكي كردستان
رشته تحصيلي
بيوشيمي
چكيده
مقدمه و اهداف: سرطان پستان يكي از رايجترين بدخيميها در بين زنان بوده كه با نرخ مرگومير بالايي همراه است. RNA هاي حلقوي (circular RNAs) دستهاي بسيار پايدار از RNA هاي طويل غير كننده يا lncRNAs هستند كه در بسياري از فرآيندهاي ژني نقش ايفا ميكنند. مشخصشده است كه RNA هاي حلقوي در بسياري از انواع بدخيميها داراي نقش ميباشند. همچنين مطالعات گسترده نقش RNA هاي حلقوي را در پاتوژنز سرطان پستان نشان داده است. بسياري از ويژگيهاي RNA هاي حلقوي همانند پايداري و فراواني بالا، آنها را به اهدافي قابلاعتماد جهت تشخيص و درمان سرطان پستان تبديل كرده است. جهت بررسي هرچه بهتر نقش RNA هاي حلقوي در تشخيص سرطان پستان، ما در اين مطالعه به بررسي ارزش تشخيصي RNA هاي حلقوي hsa-cric-0001785 (circ-ELP3) وhsa-circ-100219 (circ-FAF1) در سرم بيماران مبتلا به سرطان پستان پرداختيم.
مواد و روشها: در اين مطالعه گروه بيمار متشكل از 78 بيمار مبتلا به سرطان پستان، كه تشخيص بهتازگي (New Case) در آنها صورت گرفته بود. همچنين گروه كنترل شامل ده نفر از افراد سالمي كه وجود سرطان پستان در آنها رد شده و از نظر سن با گروه بيمار همسانسازي شده، بودند. نمونه خونگرفتهشده از بيماران در دو نوبت اخذ گرديد. نوبت اول قبل از انجام هرگونه مداخله درماني و نوبت دوم شش ماه پس از انجام مداخله درماني صورت ميگيرد. نمونهگيري در گروه كنترل فقط در يك نوبت انجام گرفت. بعد از انجام سانتريفيوژ نمونههاي خونگرفته شده و جداسازي سرم، RNA موجود در نمونه ها استخراج و براي سنجش ميزان بيان RNA هاي حلقوي circ-ELP3 و circ-FAF1 آزمايش شدند. در اين مطالعه بررسي بيان RNA هاي حلقوي به روش qRT-PCR انجام ميگيرد. جهت آناليز آماري دادهها از نرمافزار GraphPad Prism و SPSS 16 و روشهاي آماري Mann-Whitney test يا one-way ANOVA استفاده شد.
يافتهها: تجزيهوتحليل دادههاي بهدستآمده از qRT-PCR نشان داد كه ميزان بيان RNA هاي حلقوي circ-ELP3 و circ-FAF1 در نمونه سرم بيماران مبتلابه سرطان پستان نسبت به گروه كنترل داراي تغييرات چشمگيري بودند. بيان circ-ELP3 (p=0.01) در بيماران مبتلا به سرطان پستان به ميزان قابلتوجهي افزايشيافته و برعكس ميزان بيان circ-FAF1 (p<0.0001) در گروه بيماران نسبت به گروه كنترل كاهش فراواني را نشان دادند. با توجه به نمودار ROC هردو circRNAs مقادير ارزش تشخيصي آنها جهت تشخيص سرطان پستان محاسبه شدند. مقادير cutoff، سطح زير نمودار (AUC)، حساسيت و اختصاصيت براي circ-ELP3 به ترتيب 0.028، 0.733، 65% و 64% بودند. همچنين همين مقادير موارد محاسبه شده برا Circ-FAF1 به ترتيب 0.064، 0.787، 77% و 74% بودند. در اين پژوهش همچنين مقادير ارزش تشخيصي تركيب هردو circRNAs مطالعه شده سنجش شد كه به ترتيب اين مقادير براي AUC، حساسيت و اختصاصيت برابر 0.891، 96% و 62% بدست آمدند.
نتيجهگيري: درمجموع، اين مطالعه نشان داد كه ميزان بيان Circ-ELP3 در سرم بيماران مبتلا به سرطان پستان سطح بالاتري نسبت به بيان Circ-FAf1 دارد. در حالي كه مشخص شد كه سطح اين دو به ترتيب در بيماران بعد از درمان كاهش و افزايش بيان دارند. علاوه بر اين، سنجش ميزان بيان RNA هاي حلقوي circ-ELP3 و circ-FAF1 و تركيب اين دو به صورت پنل تركيبي با ميزان حساسيت 96% و اختصاصيت 62% در سرم بيماران مبتلابه سرطان پستان ابزار مناسب و غيرتهاجمي جهت تشخيص، پروگنوز و انتخاب بهترين مسير درماني در اين بيماران است.
كلمات كليدي: سرطان پستان، بيوماركر سرطاني، circular RNAs ،circ-FAF1، circ-ELP3، كارآيي تشخيصي
شماره ركورد
206549
شهر محل تحصيل
دانشگاه علوم پزشكي كردستان
گرايش رشته تحصيلي
بيوشيمي
دانشكده
پزشكي
دانشگاه
دانشگاه علوم پزشکي کردستان
استاد راهنما
محمد عبدي، حسن معيري