آناليز فيلوژنتيك انواع ژنوتيپ¬هاي ژيارديا در ايران بر اساس ژن تريوز فسفات ايزومراز TriosPisomerase (TPI)

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

پزشكي

زمينه وهدف:ژيارديازيس يك بيماري زئونوزمنتقله ازآب وغذا است كه به عنوان يك بيماري فراموش شده و از عوامل ايجاد اسهال است. ژيارديازيس داراي انتشارجهاني است كه تخمين زده مي شود سالانه حدود280ميليون نفربه اين انگل آلوده مي شوند. ژيارديا لامبليا ازلحاظ ژنتيكي شامل 8اسمبليج متفاوت است (A،B،C،D،E،F،G،H) مطالعات مختلفي نشان مي دهدكه اسمبليج هاي ژيارديا در بيماري زايي متفاوت هستند. هدف از طراحي اين مطالعه بررسي توالي نوكلئوتيدي مربوط به انواع اسمبليج هاي ژيارديا در ايران و استان كردستان و مقايسه اين توالي هاي نوكلئوتيدي با نمونه هاي موجود در بانك جهاني ژن است كه با مطالعه حاضر ميتوان تنوع ژني ژيارديازيس موجود در استان كردستان را با همديگر و ساير نقاط ايران و دنيا مقايسه نموده و ارتباط گونه هاي آلوده كننده در انسان و دام و نيز راههاي احتمالي انتقال آلودگي به انسان را با استفاده از آناليزهاي بيوانفورماتيك مولكولي مورد بررسي قرار داد. كه بررسي اين موضوع از لحاظ به كار گيري استراتژي كنترل و پيشگيري مناسبتر و بهبود وضعيت سلامت و رفاه جامعه حائز اهميت است. روش كار: اين مطالعه به‌ صورت مقطعي انجام شد. محصولاتPCR ژن تريوز فسفات ايزومراز (TPI) نمونه هاي ژيارديا در استان كردستان وگروههاي مختلف انساني و حيواني از نقاط ديگر ايران و جهان با در بانك جهاني ژن موجود بوده است. پس از بررسي مطالعات مختلف و جستجوهاي انجام شده در بانك جهاني ژن تعداد 32 توالي نوكلئوتيدي ثبت شده از نقاط مختلف جهان براي ژن مذكور انتخاب و آناليز بيوانفورماتيكي با استفاده از برنامه هاي Chromas براي اديت، Blast براي مقايسه ژنها و تعيين همولوژي، ClustalW2 براي مقايسه گروهي ژنها(alignment) ، MEGA11 براي رسم درخت فيلوژني، GenBank براي دريافت ژنهاي مشابه مورد انجام شد. در نهايت با استفاده از تمامي نرم افزارهاي ذكر شده ، مقايسه شباهتها و تفاوتها و تحليل ژنتيكي انواع ژيارديا در استان كردستان در قياس با ايران و ساير نقاط جهان انجام گرفت. يافته‌ها: Alignment 32نمونه انتخابي در اين مطالعه نشان داد كه از حدود 500نوكلئوتيد مربوط به اين ژن در كمتر از 10نوكلئوتيد تفاوت وجود دارد . بلاست نمونه هاي مربوط به استان كردستان براي ژن تريوز فسفات ايزومراز نشان داد كه اين تواليها با ساير توالي هاي ثبت شده انگل ژيارديا در ساير نقاط ايران براي همين ژن بيشتر از 95% همپوشاني و همولوژي دارد. همچنين با انتخاب چند نمونه از ايران و مقايسه آنها با ساير توالي هاي ثبت شده از ساير نقاط جهان نشان داد كه اين تشابه نيز براي نمونه هاي ايران در قياس با ساير توالي هاي ثبت شده از نقاط مختلف جهان وجود دارد كه اين همولوژي بيشتر از 95% بين نمونه هاي انساني و حيواني و نمونه هاي جدا شده از محيط زيست از قبيل منابع آب آشاميدني است. نتيجه‌گيري: تمامي تواليهاي ثبت شده مربوط به ايران تقريبا مشابهت كامل دارند كه اين ميتواند نشان دهنده وجود يك نوع ژيارديا براي هر كدام از اين اسمبليجها در تمام نقاط ايران باشد وباتوجه به اين كه نمونه هاي ژيارديا ازانسان وحيوان ومحيط زيست مثل آب آشاميدني بوده است نتيجه مي گيريم كه ژيارديا زئونوز است. دراين مطالعه سه درخت فيلوژنتيك ترسيم شده است كه در اولين درخت مقايسه فيلوژنيك براي 32 نمونه انتخاب شده ژيارديا از بانك جهاني ژن از مناطق مختلف ايران و جهان،¬ انجام شدوبه اين نتيجه رسيديم توالي هايي كه با هم در يك كمپلكس قرار مي گيرند از يك نوع اسمبليج هستند. اسمبليج Aو B در يك Root واسمبليجE در Root ديگر قرار گرفت. دومين درخت فيلوژنتيك مقايسه اي براي تمامي اسمبليجهاي ژيارديالامبليا ( به غير از اسمبليجH )از بانك جهاني ژن از مناطق مختلف جهان ويك نمونه ژيارديا آرديا به عنوان نمونه كنترل (out group) انجام شد.طبق اين درخت شباهت اسمبليج هايEوFوAباهمديگرواسمبليج هايBوCوDباهمديگر بيشتر است ودرنهايت اين6اسمبليج با اسمبليج Gتفاوت بيشتري دارند. سومين درخت فيلوژنتيك مقايسه اي براي ساب اسمبليج هايAوB ازبانك جهاني ژن براساس ژن تريوزفسفات ايزومراز انجام شد. ساب اسمبليج هايBIIIوBIV باهم شباهت دارندوبا ساب اسمبليج هاي A تفاوت دارند وازبين ساب اسمبليج هايAبيشترين تفاوت را با ساب اسمبليجAIدارند. واژگان كليدي:فيلوژنتيك؛ ژيارديا،تريوز فسفات ايزومراز(TPI)

207435

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

پزشكي

پزشكي

دانشگاه علوم پزشکي کردستان

محمدباقر خادم عرفان