شناسايي RNAs غيركد شونده طويل در پاسخ به تنش سرمايي در خيار

اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان

بيوتكنولوژي

كارشناسي ارشد

خيار يك گياه مهم اقتصادي يك ‌ساله و حساس به سرما است. حساسيت به سرماي اين محصولات هر ساله خسارات اقتصادي زيادي را براي كشاورزان به همراه دارد. با وجود معرفي برخي ارقام نسبتا مقام به سرما و شناسايي عوامل مولكولي درگير در اين تنش مانند ژن-هاي كد شونده، ديگر عوامل مولكولي مانند RNAs طويل غيركدشونده(lncRNAs) هنوز مورد بررسي قرار نگرفته‌اند. از اين رو، در اين مطالعه از رويكردهاي بيوانفورماتيك براي تجزيه و تحليل مجموعه داده‌هاي ترنسكريپتومي بافت ريشه و برگ خيار در سه تكرار تحت تيمار سرما در 3 بازه رماني 3، 12 و 24 ساعت به منظور شناسايي lncRNAs و ژن¬هاي هدف مرتبط استفاده شد. در اين مطالعه، در مجموع تعداد 251 ترنسكريپت به عنوان lncRNA شناسايي شد كه از اين ميان 36 ترنسكريپت داراي اختلاف بيان معني¬دار ميان جفت مقايسات بودند. با بررسي ژن‌هاي هدف در بالادست و پايين دست lncRNA مشخص شد 24 lncRNA داراي ژن هدف مشخص هستند. از ميان ژن¬هاي هدف، يك هليكاز از نوع RNA DEAD-box، CASP، Cycloartenol synthase، MYB و P450 به عنوان مهم¬ترين ژن¬هاي هدف با نقش پاسخ به تنش سرما و ايجاد مقاومت شناسايي شدند. اين مطالعه اولين گزارش در مورد شناسايي lncRNAs مربوط به بر اساس توالي يابي ترنسكريپتوم در خيار است كه منبع مفيدي براي مطالعات ژنوميك عملكردي، تحقيقات بيان ژن‌ها، و برنامه‌هاي اصلاح مولكولي در تنظيم مكانيسم‌هاي ژنتيكي مربوط به پاسخ به تنش سرمايي در خيارمي‌باشد.

225462

بيوتكنولوژي كشاورزي

مهندسي كشاورزي

دانشگاه صنعتي اصفهان