تعيين منشأ ژنتيكي كرباپنماز blaOXA-23 مختص آسينتوباكتر بوماني در باكتري پروتئوس ميرابيليس و بررسي ساختار ژنتيكي آن

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

ميكروب شناسي

مقدمه: پروتئوس¬ها پاتوژن¬هاي فرصت¬طلبي از خانواده انتروباكترياسه هستند كه موجب بيماري‌هاي مختلف همچون عفونت ادراري پيچيده، عفونت زخم، سوختگي، آبسه، عفونت‌هاي دستگاه تنفسي و باكتريمي مي¬شوند. با توجه به اين‌كه پروتئوس ميرابيليس يك پاتوژن مهم تلقي مي‌شود، انتقال اگزاسيلينازها از آسينتوباكتر بوماني به اين‌گونه امر مهمي تلقي مي‌شود چراكه مشكلات زيادي را براي مقابله با اين باكتري به وجود مي‌آورد و درمان را پيچيده‌تر مي‌كند. اين مطالعه با هدف تعيين منشأ ژنتيكي كرباپنماز blaOXA-23مختص آسينتوباكتر بوماني در باكتري پروتئوس ميرابيليس و بررسي ساختار ژنتيكي آن در سال 1397 انجام شد. مواد و روش¬ها: در اين مطالعه مقطعي ايزوله پروتئوس ميرابيليس جداشده در گذشته، در اين پژوهش وارد شدند. براي شناسايي باكتري از خصوصيات كشت، تست‌هاي بيوشيميايي و بررسي تشابه ژنتيكي توسطRep-PCR تشخيصي استفاده شد. حساسيت آنتي‌بيوتيكي ايزوله¬هاي پروتئوس ميرابيليس توسط دستگاه Vitek2 بررسي شد. درنهايت توالي كل ژنوم به روشIllumina خوانده شده و تمامي قطعات به وسيله نرم‌افزار به هم متصل شدند. پلاسميدهاي مربوطه نيز به طور كامل تعيين توالي شدند. ژن‌هاي مقاومت و بيماري‌زايي روي آن رديابي و با ساير نقاط جهان مقايسه گرديد. يافته‌ها: با توجه به تست‌هاي بيوشيميايي و PCR تشخيصي 4 نمونه پروتئوس ميرابيليس شناسايي شد كه بر اساس نتايج تست آنتي¬بيوگرام به كمك دستگاه Vitek2 و استاندارد UCAST بيشترين ميزان مقاومت مربوط به نيتروفورانتوئين با 256 MIC=و پس از آن تايگي سايكلين با 4MIC= در ايزوله شماره 1 پروتئوس ميرابيليس بود و مابقي آنتي¬بيوتيك¬ها نسبت به اين باكتري حساس بودند. ايزوله¬ پروتئوس شماره 1 حاوي كرباپنم¬ OXA-23 براي مقايسه با گزارش¬هاي ديگر از ساير نقاط دنيا، با تكنيك Sequencing Illumina مورد بررسي قرار گرفت و با شماره Accession Number در سايتNCBI با شماره NZ_JABVMA000000000.1 ثبت گرديد. 4 پلاسميد شناسايي¬ شد و سه ژن اصلي به نام-هاي TEM-171 (عامل مقاومت به مونوباكتام، سفالسپورين)، ژن APH(3)-IIA (عامل مقاومت به آمينوگليكوزيدها) و ژن sul1 (عامل مقاومت به سولفوناميدها) عامل مقاومت توسط پلاسميد در باكتري شناسايي شد. نتيجه¬گيري: ابا توجه به نتايج MIC موجب ايجاد مقاومت چنداني به آنتي¬بيوتيك¬هاي اشاره شده نشده-اند. محل ژنblaOXA-23 نيز در بين دو ORF (open reading frame) قرار داشت كه هيچكدام توالي الحاقي يا در ساختارهاي ترانسپوزوني نبودند. اينكه اين ژن چگونه در اين ساختار قرار گرفته است نامشخص مي¬باشد. كلمات كليدي: "الومينا سكانسينگ"؛ "پروتئوس ميرابيليس"؛ "پلاسميد"؛ "ژن blaOXA-23 " و "كرباپنماز".

81899

دانشگاه علوم پزشكي كردستان

ميكروب شناسي

پزشكي

دانشگاه علوم پزشکي کردستان

هيمن سليمي زند، رشيد رمضان زاده